1、半胱氨酸盐酸盐可溶于水，制成针剂或片剂可迅速被人体所吸收。它是羧甲基半胱氨酸和乙酰基半胱氨酸生产的主要原料。 [1]  2、在临床上能治疗白血球减少症，及由于施用抗癌药物和放射性药物所引起的白血球减少症，以及重金属中毒解毒剂。此外还用于治疗中毒性肝炎、血小板减少、皮肤溃疡，并能预防肝坏死症，有治疗气管炎和化痰作用，对丙稀晴和芳香族中毒有解毒作用，有预防放射线损伤的作用

3、面包改良剂：促进发酵、防止氧化的作用。在食品的方面作为面包速成促进剂，能改变面包和食品的风味。

4、在化妆品方面可用于化妆品的烫发精、防晒霜、生发香水和头发调理剂等等。

5、营养增补剂、抗氧化剂、护色剂：用于天然果汁，防止维生素C氧化及色变。

用途与注意事项： 面粉处理剂、营养增补剂。作为营养增补剂，其添加量不应超过总蛋白质含量的2.3%（包括L-胱氨酸）。我国《食品添加剂使用卫生标准》（GB2760―2011）中规定：用于发酵面制品，0.06g/kg。冷冻米面制品*使用量为0.6g/kg（以 L-半胱氨酸盐酸盐计）。